Borotiinnada DELLA waa kuwo aad loo ilaaliyonidaamiyayaasha koritaankakuwaas oo door muhiim ah ka ciyaara xakamaynta horumarinta dhirta iyadoo laga jawaabayo tilmaamaha gudaha iyo deegaanka. DELLA waxay u dhaqantaa sidii nidaamiye qoraal ah waxaana loo shaqaaleeyaa inay bartilmaameedsato dhiirrigeliyeyaasha iyadoo ku xiran arrimaha qoraalka (TFs) iyo histone H2A iyada oo loo marayo GRAS-keeda. Daraasado dhowaan la sameeyay ayaa muujiyay in xasilloonida DELLA ay si tarjumaad ah u maamusho laba farsamo: polyubiquitination oo ay keento phytohormone gibberellin, taasoo horseedaysa burbur degdeg ah, iyo isku-darka wax-ka-beddelayaasha yaryar ee ubiquitin-ka u eg (SUMO) si loo kordhiyo ururinteeda. Intaa waxaa dheer, dhaqdhaqaaqa DELLA waxaa si firfircoon u nidaamiya laba glycosylations oo kala duwan: isdhexgalka DELLA-TF waxaa xoojiya O-fucosylation laakiin waxaa joojiya wax-ka-beddelka O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc). Si kastaba ha ahaatee, doorka fosforylation-ka DELLA weli ma cadda, maadaama daraasadihii hore ay muujiyeen natiijooyin is khilaafsan, oo u dhexeeya kuwa muujinaya in fosforylation-ku uu kor u qaado ama uu yareeyo burburka DELLA ilaa kuwa kale oo muujinaya in fosforylation-ku uusan saameyn ku yeelan xasilloonideeda. Halkan, waxaan ku aqoonsaneynaa goobaha fosforylation-ka ee REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) oo laga nadiifiyay Arabidopsis thaliana iyadoo la adeegsanayo falanqaynta cufka spectrometry waxayna muujinaysaa in fosfoorasaydhka laba peptides RGA ah oo ku yaal gobollada PolyS iyo PolyS/T uu kor u qaado isku xidhka H2A iyo dhaqdhaqaaqa RGA ee la xoojiyay. Xiriirka RGA iyo dhiirrigeliyeyaasha bartilmaameedka ah. Si gaar ah, fosfoorasaydhku ma saameeyo isdhexgalka RGA-TF ama xasilloonida RGA. Daraasaddeennu waxay muujinaysaa habka molecular-ka ee fosfoorasaydhku ku kiciyo dhaqdhaqaaqa DELLA.
Si loo caddeeyo doorka fosfoorasaydhka ee nidaaminta shaqada DELLA, waa muhiim in la aqoonsado goobaha fosfoorasaydhka DELLA ee gudaha jirka iyo in la sameeyo falanqayn shaqeynaya dhirta. Iyada oo la nadiifinayo isku-dhafka soo-saarka dhirta oo ay ku xigto falanqaynta MS/MS, waxaan aqoonsannay dhowr fosfoorasaydh oo ku jira RGA. Xaaladaha yaraanta GA, fosfoorasaydhka RHA wuu kordhaa, laakiin fosfoorasaydhku ma saameeyo xasilloonidiisa. Waxaa muhiim ah, baaritaannada co-IP iyo ChIP-qPCR waxay shaaca ka qaadeen in fosfoorasaydhka gobolka PolyS/T ee RGA uu kor u qaado isdhexgalka H2A iyo xiriirka uu la leeyahay dhiirrigeliyeyaasha bartilmaameedka ah, taasoo muujinaysa habka fosfoorasaydhka uu u kiciyo shaqada RGA.
RGA waxaa loo shaqaaleeyaa si ay u beegsato chromatin iyada oo loo marayo isdhexgalka qaybta hoose ee LHR1 iyo TF ka dibna waxay ku xidhataa H2A iyada oo loo marayo gobolkeeda PolyS/T iyo qaybta hoose ee PFYRE, taasoo samaysa isku-dhafka H2A-RGA-TF si loo xasiliyo RGA. Fosforylinta Pep 2 ee gobolka PolyS/T ee u dhexeeya qaybta DELLA iyo qaybta GRAS iyada oo loo marayo kinase aan la garanayn waxay kor u qaadaysaa isku-xidhka RGA-H2A. Borotiinka rgam2A ee isbeddelay wuxuu baabi'iyaa fosforylation-ka RGA wuxuuna qaataa qaab-dhismeed borotiin oo kala duwan si uu u farageliyo isku-xidhka H2A. Tani waxay keentaa khalkhalgelinta isdhexgalka TF-rgam2A ee ku-meel-gaarka ah iyo kala-goynta rgam2A ee chromatin-ka bartilmaameedka ah. Shaxdani waxay muujinaysaa oo keliya cadaadiska qoraalka ee RGA-dhexdhexaadka ah. Qaab la mid ah ayaa lagu sharxi karaa kicinta qoraalka ee RGA-dhexdhexaadka ah, marka laga reebo in isku-dhafka H2A-RGA-TF uu kor u qaadi doono qoraalka hidda-wadaha bartilmaameedka ah iyo ka-saarista fosforylation-ka rgam2A uu hoos u dhigi doono qoraalka. Jaantuska wax laga beddelay Huang et al.21.
Dhammaan xogta tirada waxaa lagu falanqeeyay tirakoob ahaan iyadoo la adeegsanayo Excel, kala duwanaansho muhiim ahna waxaa lagu go'aamiyay iyadoo la adeegsanayo imtixaanka t ee Ardayga. Ma jirin habab tirakoob oo loo isticmaalay in si hordhac ah loo go'aamiyo cabbirka muunadda. Ma jirin xog laga saaray falanqaynta; tijaabada lama kala soocin; cilmi-baarayaashu ma indho la'aan ayay u arkayeen qaybinta xogta inta lagu jiray tijaabada iyo qiimeynta natiijooyinka. Cabbirka muunadda waxaa lagu muujiyay faylka xogta iyo faylka xogta isha.
Wixii macluumaad dheeraad ah oo ku saabsan naqshadeynta daraasadda, fiiri Warbixinta Faylalka Dabiiciga ah ee la xidhiidha maqaalkan.
Xogta proteomics ee cufnaanta spectrometry ayaa lagu biiriyay ururka ProteomeXchange iyada oo loo marayo kaydka lammaanaha PRIDE66 oo leh aqoonsiga xogta PXD046004. Dhammaan xogta kale ee la helay intii lagu jiray daraasaddan waxaa lagu soo bandhigay Macluumaadka Dheeraadka ah, Faylasha Xogta Dheeraadka ah, iyo Faylasha Xogta Cayriin. Xogta isha waxaa loo bixiyay maqaalkan.
Waqtiga boostada: Noofambar-08-2024