Fosforyaalku waxa ay dhaqaajisaa maamulaha kobaca sayid DELLA ee Arabidopsis iyada oo kor u qaadaysa xidhiidhka histone H2A oo leh chromatin.

borotiinada DELLA waa sayid la xafidaynidaamiya koritaankakuwaas oo door dhexe ka ciyaara xakamaynta horumarinta dhirta si looga jawaabo tilmaamaha gudaha iyo deegaanka. DELLA waxay u shaqeysaa sidii nidaamiye qoraal ah waxaana loo qortaa si ay u beegsato dhiirrigeliyeyaasha iyadoo lagu xirayo qodobbada qoraalka (TFs) iyo histone H2A iyada oo loo marayo xayndaabkeeda GRAS. Daraasadihii ugu dambeeyay ayaa muujiyay in xasilloonida DELLA ay tahay mid dib-u-tarjumid ahaan lagu maamulo iyada oo loo marayo laba hab: polyubiquitination oo ay keentay phytohormone gibberellin, taas oo u horseedaysa hoos u dhac degdeg ah, iyo isku-dhafka yar-yar ee wax-beddelayaasha ubiquitin-sida (SUMO) si loo kordhiyo ururinteeda. Intaa waxaa dheer, dhaqdhaqaaqa DELLA waxaa si firfircoon u habeeya laba glycosylations kala duwan: isdhexgalka DELLA-TF waxaa xoojiyay O-fucosylation laakiin waxaa xannibay O-linked N-acetylglucosamine (O-GlcNAc). Si kastaba ha ahaatee, doorka phosphorylation DELLA ayaa weli ah mid aan caddayn, maadaama daraasadihii hore ay muujiyeen natiijooyin iska soo horjeeda, oo u dhexeeya kuwa muujinaya in fosforyaalku ay kor u qaadaan ama ay yareeyaan xaalufka DELLA kuwa kale oo muujinaya in fosforyaalku aysan saameyn ku yeelanayn xasilloonideeda. Halkan, waxaan ku aqoonsanaynaa goobaha fosforyaalka ee REPRESSORga1-3(RGA, AtDELLA) oo laga nadiifiyey Arabidopsis thaliana iyadoo lagu eegayo falanqaynta spectrometry mass oo tustay in fosforyaalka laba peptides ee RGA ee PolyS iyo PolyS/T ay kor u qaaddo isku xidhka H2A iyo dhaqdhaqaaqa RGA ee la xoojiyay. Ururka RGA oo leh dhiirrigeliyeyaal la beegsanayo. Gaar ahaan, fosforyaalku ma saameeyaan isdhexgalka RGA-TF ama xasilloonida RGA. Daraasaddeenu waxay daaha ka qaadaysaa habka molecular ee ay fosforyaalku u keento dhaqdhaqaaqa DELLA.
Si loo caddeeyo doorka phosphorylation-ka ee habaynta shaqada DELLA, waa muhiim in la aqoonsado goobaha phosphorylation DELLA ee vivo oo lagu sameeyo falanqaynta shaqaynta ee dhirta. Nadiifinta u dhowaanshaha ka-soo-baxyada dhirta oo ay ku xigto falanqaynta MS/MS, waxaan ku aqoonsannay dhowr fosfosites gudaha RGA. Marka la eego xaaladaha yaraanta GA, fosforyaalka RHA wuu kordhaa, laakiin fosforyaalku ma saameynayso xasilloonida. Muhiimad ahaan, co-IP iyo ChIP-qPCR assays ayaa shaaca ka qaaday in fosforyaalka ee gobolka PolyS/T ee RGA ay kor u qaaddo is dhexgalka ay la leedahay H2A iyo xiriirka ay la leedahay dhiirrigeliyeyaasha bartilmaameedka ah, oo muujinaya habka ay fosforyaalku u keento shaqada RGA.
RGA waxaa loo shaqaaleysiiyay in lagu beegsado chromatin iyada oo la is dhexgalka LHR1 subdomain la leh TF ka dibna ku xidha H2A iyada oo loo sii marayo gobolkeeda PolyS/T iyo PFYRE subdomain, samaynta dhismaha H2A-RGA-TF si loo xasiliyo RGA. Fosforyaalka Pep 2 ee gobolka PolyS/T ee u dhexeeya domainka DELLA iyo GRAS ee kinase aan la aqoonsan ayaa kor u qaadaysa isku xidhka RGA-H2A. Borotiinka mutant ee rgam2A wuxuu baabi'iyaa fosforyaalka RGA wuxuuna qaataa is-yeelka borotiinka ka duwan si uu u farageliyo isku-xidhka H2A. Tani waxay keenaysaa xasiloonidarada isdhexgalka TF-rgam2A ee ku meel gaadhka ah iyo kala soocida rgam2A ee chromatin bartilmaameedka. Jaantuskani waxa uu muujinayaa kaliya cadaadis qoraal ah oo ay dhexdhexaadisay RGA. Qaab la mid ah ayaa lagu sifayn karaa firfircoonida qoraal-qorista ee dhexdhexaadinta RGA, marka laga reebo in isku-xidhka H2A-RGA-TF uu kor u qaadi doono qorista hidda-wadaha iyo fosforyaalka rgam2A ay yarayn doonto qoraalka. Sawirka laga beddelay Huang et al.21.
Dhammaan xogta tiro-koobsi ahaan ayaa loo falanqeeyay iyadoo la isticmaalayo Excel, kala duwanaanshuhuna waa la go'aamiyay iyadoo la isticmaalayo imtixaanka Student's t. Hababka tirakoobka looma isticmaalin si hordhac ahaan loo go'aamiyo cabbirka muunadda. Wax xog ah lagama saarin falanqaynta; tijaabadu lama kala soocnayn; cilmi-baarayaashu ma indho la'aan qaybinta xogta inta lagu jiro tijaabada iyo qiimeynta natiijooyinka. Cabbirka muunadda waxa lagu tilmaamay halyeyga shaxanka iyo faylka xogta isha.
Macluumaad dheeraad ah oo ku saabsan naqshadda daraasadda, ka eeg Warbixinta Portfolio-ga Dabiiciga ah ee la xidhiidha maqaalkan.
Xogta spectrometry mass spectrometry proteomics ayaa lagu biiriyay isbahaysiga ProteomeXchange iyada oo loo marayo kaydka lamaanaha PRIDE66 oo wata aqoonsiga xogta PXD046004. Dhammaan xogta kale ee la helay inta lagu guda jiro daraasaddan waxaa lagu soo bandhigay Macluumaadka Dheeraadka ah, Faylasha Xogta Dheeraadka ah, iyo Faylasha Xogta Ceyriinka ah. Xogta isha ayaa lagu siiyay maqaalkan.