weydiinbg

Aqoonsiga genome-ballaaran iyo falanqaynta muujinta ee qodobbada nidaaminta korriinka mustard ee xaaladaha abaarta

Qaybinta xilliyeed ee roobabka ee Gobolka Guizhou waa mid aan sinnayn, iyadoo roobab badan ay gu'ga iyo xagaaga yihiin, laakiin geedo la kufsaday ayaa u nugul walaaca abaarta ee dayrta iyo jiilaalka, taas oo si ba'an u saamaysa dhalidda. Mustard waa dalagga saliideed ee gaarka ah oo inta badan laga beero Gobolka Guizhou. Waxay leedahay dulqaad xooggan oo abaareed waxaana lagu beeri karaa dhulka buuraleyda ah. Waa kheyraad qani ah oo laga helo hiddo-wadaha abaarta u adkaysta. Helitaanka hidde-sideyaasha abaarta u adkaysta ayaa muhiimad muhiim ah u leh hagaajinta noocyada khardal. iyo hal-abuurnimada ilaha jeermiska. Qoyska GRF waxay door muhiim ah ka ciyaaraan korriinka dhirta iyo korriinka iyo wax ka qabashada walaaca abaarta. Waqtigan xaadirka ah, hiddo-wadaha GRF waxaa laga helay Arabidopsis 2, bariiska (Oryza sativa) 12, raspeseed 13, suuf (Gossypium hirsutum) 14, sarreen (Triticum). aestivum)15, masago luul ah (Setaria italica)16 iyo Brassica17, laakiin ma jiraan warbixino ku saabsan hiddo-wadaha GRF ee laga helay iniin khardal ah. Daraasaddan, hiddo-wadaha qoyska GRF ee khardal ayaa lagu aqoonsaday heerka genom-ballaaran iyo sifooyinkooda jireed iyo kiimikaad, cilaaqaadyada kobcinta, homology, motifs la ilaaliyo, qaab-dhismeedka hidda-wadaha, nuqullada hidda-wadaha, cis-elements iyo heerka seedling (marxaladda afar-caleen) ayaa la falanqeeyay. Qaababka muujinta ee walaaca abaarta ayaa si guud loo falanqeeyay si loo helo sal cilmiyeysan oo daraasado dheeri ah lagu sameeyo shaqada suurtagalka ah ee hiddo-wadaha BjGRF ee jawaabta abaarta iyo in la bixiyo hiddo-wadaha murashaxiinta taranka khardal abaarta u adkaysata.
Afar iyo afartan hiddo-sideyaasha BjGRF ayaa lagu aqoonsaday genome-ka Brassica juncea iyadoo la adeegsanayo laba baaritaan oo HMMER ah, kuwaas oo dhammaantood ka kooban qaybaha QLQ iyo WRC. Taxanayaasha CDS ee hiddo-wadaha BjGRF ee la aqoonsaday ayaa lagu soo bandhigay shaxda Dheeraadka ah S1. BjGRF01–BjGRF34 waxaa lagu magacaabay iyadoo ku saleysan meesha ay ku taal koromosoomyada. Sifooyinka physicochemical ee qoyskan ayaa tilmaamaya in dhererka amino acid uu aad u kala duwan yahay, laga bilaabo 261 aa (BjGRF19) ilaa 905 aa (BjGRF28). Barta isoelectric ee BjGRF waxay u dhaxaysaa 6.19 (BjGRF02) ilaa 9.35 (BjGRF03) celcelis ahaan 8.33, iyo 88.24% BjGRF waa borotiinka aasaasiga ah. Miisaanka molecular ee la saadaaliyay ee BjGRF waa 29.82 kDa (BjGRF19) ilaa 102.90 kDa (BjGRF28); tusmada xasilloonida ee borotiinka BjGRF waxay u dhaxaysaa 51.13 (BjGRF08) ilaa 78.24 (BjGRF19), dhamaantood way ka weyn yihiin 40, taas oo muujinaysa in index fatty acid index u dhexeeya 43.65 (BjGRF01) ilaa 78.78 (BjGRF08) (BjGRF22). (BjGRF31) ilaa -0.45 (BjGRF22), dhammaan borotiinada hydrophilic BjGRF waxay leeyihiin qiyamka GRAVY taban, taas oo ay sabab u tahay la'aanta hydrophobicity ee ay sababtay hadhaaga. Saadaasha deegaan-hoosaadka hoose waxay muujisay in 31 BjGRF borotiinada ku-meel-gaadhka ah lagu meelayn karo xudunta, BjGRF04 waxaa lagu meelayn karaa peroxisomes, BjGRF25 waxaa lagu meelayn karaa cytoplasm, iyo BjGRF28 waxaa lagu meelayn karaa chloroplasts. arrin qoraal ah.
Falanqaynta phylogenetic ee qoysaska GRF ee noocyada kala duwan waxay kaa caawin kartaa inaad barato hawlaha hidda-socodka. Sidaa darteed, taxanaha amino acid-ka buuxa ee 35 xabo, 16 bagalka, 12 bariis, 10 masago iyo 9 Arabidopsis GRFs ayaa la soo dejiyey waxaana la dhisay geed phylogenetic ah oo ku salaysan 34 la aqoonsaday hiddo-wadaha BjGRF (Jaantus 1). Saddexda qoys waxay ka kooban yihiin xubno kala duwan; 116 GRF TFs waxay u qaybsan yihiin saddex qoys oo kala duwan (kooxo A ~ C), oo ka kooban 59 (50.86%), 34 (29.31%) iyo 23 (19.83)% ee GRFs, siday u kala horreeyaan. Waxaa ka mid ah, 34 xubnaha qoyska BjGRF waxay ku kala firirsan yihiin 3 qoys hoose: 13 xubnood kooxda A (38.24%), 12 xubnood ee kooxda B (35.29%) iyo 9 xubnood ee kooxda C (26.47%). Inta lagu jiro nidaamka polyploidization in khardal, tirada hiddo-wadaha BjGRFs ee qoys hoosaadyada kala duwan way ka duwan yihiin, kordhinta hidda-wadaha iyo luminta waxaa laga yaabaa inay dhaceen. Waxaa xusid mudan in Group C ay ku jiraan 2 bariis iyo 1 masago oo GRF ah, iyadoo inta badan bariiska iyo masago GRF la isugu geeyey hal laan, taasoo muujineysa in BjGRF ay xiriir dhow la leeyihiin dicots. Waxaa ka mid ah, daraasadaha ugu qoto-dheer ee ku saabsan shaqada GRF ee Arabidopsis thaliana waxay saldhig u tahay daraasadaha shaqeynta ee BjGRFs.
Geedka phylogenetic ee iniin khardal ah oo ay ku jiraan Brassica napus, Brassica napus, bariis, masago iyo xubno ka tirsan qoyska Arabidopsis thaliana GRF.
Falanqaynta hiddo-wadaha soo noqnoqda ee qoyska mustard GRF. Xariiqda cawl ee gadaasheeda waxay ka dhigan tahay xannibaad isku xidhan oo ku jirta genome-ga iniin khardal ah, xariiqda cas waxay ka dhigan tahay laba qaybood oo soo noqnoqonaya oo ah hidda-wadaha BjGRF;
BjGRF muujinta hidda-wadaha ee walaaca abaarta ee marxaladda caleenta afraad. Xogta qRT-PCR waxa lagu muujiyay shaxda Dheeraadka ah S5. Farqiga weyn ee xogta waxaa lagu muujiyey xarfaha yaryar.
Iyadoo cimiladu ay sii socoto isbeddelka cimilada, daraasadda sida dalagyadu ula qabsadaan walaaca abaarta iyo hagaajinta hababka dulqaadkooda ayaa noqotay mawduuc cilmi baaris oo kulul18. Abaarta ka dib, qaab-dhismeedka qaab-dhismeedka, muujinta hidda-socodka iyo hababka dheef-shiid kiimikaadka dhirta ayaa isbeddeli doona, taas oo keeni karta joojinta photosynthesis iyo khalkhalka dheef-shiid kiimikaadka, oo saameeya wax-soo-saarka iyo tayada dalagyada19,20,21. Marka dhirtu dareemaan calaamadaha abaarta, waxay soo saaraan farriimaha labaad sida Ca2+ iyo phosphatidylinositol, waxay kordhiyaan xoojinta calcium ion intracellular waxayna dhaqaajiyaan shabakada nidaaminta ee borotiinka fosfooraska borotiinka22,23. Borotiinka bartilmaameedka ugu dambeeya wuxuu si toos ah ugu lug leeyahay difaaca gacanta ama wuxuu nidaamiyaa muujinta hiddo-wadaha walaaca ee la xiriira iyada oo loo marayo TFs, kor u qaadista dulqaadka dhirta ee stress24,25. Markaa, TF-yadu waxay door muhiim ah ka ciyaaraan wax ka qabashada walaaca abaarta. Marka loo eego isku xigxiga iyo sifooyinka DNA-da ee isku xidha TFs ee ka jawaabaya walaaca abaarta, TFs waxa loo qaybin karaa qoysas kala duwan, sida GRF, ERF, MYB, WRKY iyo qoysas kale26.
Qoyska hidda-wadaha GRF waa nooc ka mid ah TF-ga dhirta-gaar ah oo ka ciyaara door muhiim ah dhinacyo kala duwan sida korriinka, horumarka, gudbinta calaamadaha iyo jawaabaha difaaca dhirta27. Tan iyo markii ugu horeysay ee GRF hiddo-wadaha lagu aqoonsaday O. sativa28, aad iyo aad u badan GRF genes ayaa lagu aqoonsaday noocyo badan oo la muujiyay in ay saameeyaan koritaanka dhirta, horumarinta iyo jawaab celinta stress8, 29, 30,31,32. Markii la daabacay taxanaha genome Brassica juncea, aqoonsiga qoyska hidda-wadaha BjGRF waxa ay noqotay suurtagal33. Daraasaddan, 34 hiddo-wadaha BjGRF ayaa lagu aqoonsaday dhammaan genome-ga khardal oo dhan waxaana lagu magacaabay BjGRF01-BjGRF34 iyadoo lagu saleynayo booskooda koromosoomyada. Dhammaantood waxay ka kooban yihiin xayndaabyo QLQ iyo WRC aadka loo ilaaliyo. Falanqaynta sifooyinka physicochemical waxay muujisay in kala duwanaanshaha lambarada amino acid iyo miisaanka molecular ee borotiinka BjGRF (marka laga reebo BjGRF28) aysan ahayn mid muhiim ah, taas oo muujinaysa in xubnaha qoyska BjGRF ay yeelan karaan shaqooyin isku mid ah. Falanqaynta qaab dhismeedka hidda-wadaha ayaa muujisay in 64.7% hiddo-wadaha BjGRF ay ka kooban yihiin 4 exons, taas oo muujinaysa in qaab-dhismeedka hidda-wadaha BjGRF uu yahay mid ilaa xad lagu ilaalinayo horumarka, laakiin tirada exons ee BjGRF10, BjGRF16, BjGRP28 iyo BjGRF29 hiddo-wadaha ayaa ka weyn. Daraasaduhu waxay muujiyeen in isku-darka ama tirtiridda exons ama introns ay keeni karaan kala duwanaansho qaab dhismeedka hidda-wadaha iyo shaqada, sidaas darteed abuurista hiddo-wadaha cusub34,35,36. Sidaa darteed, waxaan ku qiyaaseynaa in intron ee BjGRF uu lumay inta lagu guda jiro horumarinta, taas oo keeni karta isbeddel ku yimaada shaqada hidda-socodka. Iyadoo la raacayo daraasadaha jira, waxaan sidoo kale ogaanay in tirada introns ay la xiriirto muujinta hidda-socodka. Marka tirada introns ee hiddo-wadaha ay badan tahay, hiddesigu wuxuu si dhakhso ah uga jawaabi karaa arrimo kala duwan oo aan fiicnayn.
Isku-duubnida hidde-sidaha waa arrin weyn oo ku jirta hiddaha iyo horumarinta hidde-sidaha37. Daraasadaha la xiriira ayaa muujiyay in nuqul ka mid ah hidda-wadaha aysan kordhinaynin oo kaliya tirada hiddo-wadaha GRF, laakiin sidoo kale waxay u adeegtaa sidii hab lagu soo saari lahaa hiddo-wadaha cusub si ay uga caawiso dhirta inay la qabsato xaalado deegaan oo xun38. Wadar dhan 48 lammaane oo hidde-sideyaal ah ayaa laga helay cilmi-baadhistan, kuwaas oo dhammaantood ahaa nuqulo kala qaybsan, taas oo muujinaysa in nuqullada qaybuhu ay yihiin habka ugu weyn ee kordhinta tirada hidde-sidayaasha qoyskan. Waxaa lagu sheegay suugaanta in nuqul ka mid ah nuqulku uu si wax ku ool ah u horumarin karo kordhinta xubnaha qoyska GRF ee Arabidopsis iyo strawberry, mana jiro nuqul ka mid ah hiddasidaha qoyskan laga helay mid ka mid ah noocyada27,39. Natiijooyinka daraasaddan ayaa la socota daraasado jira oo ku saabsan Arabidopsis thaliana iyo qoysaska strawberry, iyagoo soo jeedinaya in qoyska GRF ay kordhin karaan tirada hiddo-wadaha oo ay soo saaraan hiddo-wadeyaal cusub iyada oo loo marayo nuqul ka mid ah dhirta kala duwan.
Daraasaddan, wadarta 34 hiddo-wadaha BjGRF ayaa lagu aqoonsaday iniin khardal ah, kuwaas oo loo qaybiyay 3 qoys hoose. Hidde-sidayaashani waxa ay muujiyeen waxyaalo la dhawray oo la mid ah iyo qaab-dhismeedka hidde-sidaha. Falanqaynta collinearity ayaa shaaca ka qaaday 48 lammaane oo qayb ka mid ah nuqullada in khardal ah. Gobolka dhiirigeliyaha BjGRF wuxuu ka kooban yahay walxo fal-celin ah oo la xidhiidha jawaabta iftiinka, jawaabta hoormoonka, jawaab celinta walaaca deegaanka, iyo koritaanka iyo horumarka. Muujinta 34 hiddo-wadaha BjGRF ayaa lagu ogaaday marxaladda abuuritaanka iniin khardal ah (xididdada, afkoda, caleemaha), iyo qaabka muujinta 10 hiddo-wadaha BjGRF ee xaaladaha abaarta. Waxaa la ogaaday in qaababka muujinta hiddo-wadaha BjGRF ee walaaca abaaruhu ay la mid yihiin oo laga yaabo inay isku mid yihiin. ku lug lahaanshaha sharci-dejinta khasabka ah ee abaaraha. Hidde-sidayaasha BjGRF03 iyo BjGRF32 ayaa laga yaabaa inay doorar sharciyeed togan ka ciyaaraan walaaca abaarta, halka BjGRF06 iyo BjGRF23 ay door ka ciyaaraan diiqada abaarta sida miR396 hiddo-wadaha bartilmaameedka ah. Guud ahaan, daraasaddeenu waxay bixisaa aasaas bayooloji oo mustaqbalka ah ee helitaanka shaqada hidda-wadaha BjGRF ee dhirta Brassicaceae.
Abuurka khardal ee loo adeegsaday tijaabadan waxaa bixiyay Machadka Cilmi-baarista Shiidaalka ee Guizhou, Akademiyada Sayniska Beeraha ee Guizhou. Dooro iniinaha oo dhan oo ku beer ciidda (substrate: carro = 3:1), oo soo ururi xididada, afkoda iyo caleemaha ka dib marxaladda afarta caleen. Dhirta waxaa lagu daweeyay 20% PEG 6000 si loogu ekaado abaarta, caleemahana waxaa la guray 0, 3, 6, 12 iyo 24 saac kadib. Dhammaan shaybaarada dhirta ayaa isla markiiba lagu barafoobay nitrogen dareere ah ka dibna lagu kaydiyay qaboojiye -80°C si loo tijaabiyo xiga.
Dhammaan xogta la helay ama la falanqeeyay intii lagu jiray daraasaddan waxay ku jiraan maqaallada la daabacay iyo faylasha macluumaadka dheeraadka ah.


Waqtiga boostada: Jan-22-2025