baaritaanbg

Falanqaynta aqoonsiga iyo muujinta hidde-sidaha oo dhan ee arrimaha xakamaynta koritaanka mustard-ka xaaladaha abaarta

Qaybinta xilliyeed ee roobabka ee Gobolka Guizhou waa mid aan sinnayn, iyadoo roobab badan ay ka da'aan guga iyo xagaaga, laakiin geedo yaryar oo rapeseed ah ayaa u nugul cadaadiska abaarta xilliga dayrta iyo jiilaalka, taas oo si weyn u saameysa wax soo saarka. Mustard waa dalag gaar ah oo saliid ah oo inta badan laga beero Gobolka Guizhou. Waxay leedahay dulqaad abaareed oo xooggan waxaana lagu beeri karaa meelaha buuraleyda ah. Waa kheyraad qani ah oo hiddo-sideyaal u adkaysta abaarta. Soo helitaanka hiddo-sideyaasha u adkaysta abaarta ayaa muhiimad weyn u leh horumarinta noocyada mustard-ka. iyo hal-abuurka kheyraadka jeermiska. Qoyska GRF waxay door muhiim ah ka ciyaaraan koritaanka iyo horumarka dhirta iyo jawaabta cadaadiska abaarta. Waqtigan xaadirka ah, hiddo-sideyaasha GRF waxaa laga helay Arabidopsis 2, bariis (Oryza sativa) 12, rapeseed 13, cudbi (Gossypium hirsutum) 14, sarreen (Triticum). aestivum)15, millet luul (Setaria italica)16 iyo Brassica17, laakiin ma jiraan warbixino ku saabsan hiddo-sideyaasha GRF ee laga helay mustard-ka. Daraasaddan, hiddo-sidayaasha qoyska GRF ee mustard-ka ayaa lagu aqoonsaday heerka hidde-sideyaasha oo dhan, astaamaha jireed iyo kuwa kiimikada, xiriirka isbeddelka, isku-dhafka, qaababka la ilaaliyo, qaab-dhismeedka hidda-wadaha, nuqullada hidda-wadaha, walxaha cis-ka iyo marxaladda geedo-geedeedka (marxaladda afar-caleen) ayaa la falanqeeyay. Qaababka muujinta ee hoos yimaada cadaadiska abaarta ayaa si buuxda loo falanqeeyay si loo bixiyo saldhig cilmiyeed oo loogu talagalay daraasado dheeraad ah oo ku saabsan shaqada suurtagalka ah ee hidda-wadaha BjGRF ee ka jawaabista abaarta iyo in la bixiyo hiddo-sidayaasha musharixiinta ah ee taranka mustard-ka u dulqaadan kara abaarta.
Soddon iyo afar hiddo-side BjGRF ayaa lagu aqoonsaday hidde-sideyaasha Brassica juncea iyadoo la adeegsanayo laba baaritaan oo HMMER ah, kuwaas oo dhammaantood ka kooban domain-yada QLQ iyo WRC. Taxanaha CDS ee hiddo-sideyaasha BjGRF ee la aqoonsaday waxaa lagu soo bandhigay Shaxda Dheeraadka ah ee S1. BjGRF01–BjGRF34 waxaa lagu magacaabay iyadoo lagu saleynayo goobta ay ku yaalaan koromosoomka. Sifooyinka fiisikoolojiga ee qoyskan waxay muujinayaan in dhererka amino acid uu aad u kala duwan yahay, laga bilaabo 261 aa (BjGRF19) ilaa 905 aa (BjGRF28). Barta isoelectric ee BjGRF waxay u dhaxaysaa 6.19 (BjGRF02) ilaa 9.35 (BjGRF03) oo celcelis ahaan ah 8.33, iyo 88.24% BjGRF waa borotiin aasaasi ah. Kala duwanaanshaha miisaanka molecular-ka ee la saadaaliyay ee BjGRF waa laga bilaabo 29.82 kDa (BjGRF19) ilaa 102.90 kDa (BjGRF28); tusmada xasillooni darrada ee borotiinada BjGRF waxay u dhaxaysaa 51.13 (BjGRF08) ilaa 78.24 (BjGRF19), dhammaantood way ka weyn yihiin 40, taasoo muujinaysa in tusmada aashitada dufanka leh ay u dhaxayso 43.65 (BjGRF01) ilaa 78.78 (BjGRF22), celceliska hydrophilicity (GRAVY) wuxuu u dhexeeyaa -1.07 (BjGRF31) ilaa -0.45 (BjGRF22), dhammaan borotiinada BjGRF hydrophilic waxay leeyihiin qiimayaal GRAVY taban, taasoo laga yaabo inay sabab u tahay la'aanta hydrophobicity oo ay keento haraaga. Saadaasha deegaan-hoosaadka unugyada ayaa muujisay in borotiinnada 31 BjGRF ee la codeeyay ay ku yaalli karaan xudunta, BjGRF04 waxaa lagu meelayn karaa peroxisomes, BjGRF25 waxaa lagu meelayn karaa cytoplasm-ka, BjGRF28-na waxaa lagu meelayn karaa chloroplasts (Jadwalka 1), taasoo muujinaysa in BjGRFs laga yaabo inay ku yaalliin xudunta oo ay ciyaaraan door muhiim ah oo sharciyeyn ah oo ah qodob qoraal ah.
Falanqaynta phylogenetic ee qoysaska GRF ee noocyada kala duwan ayaa kaa caawin karta barashada shaqooyinka hiddaha. Sidaa darteed, taxanaha amino acid-ka dhererka buuxa ee 35 rapeseed, 16 turnip, 12 bariis, 10 millet iyo 9 Arabidopsis GRFs ayaa la soo dejiyay waxaana la dhisay geed phylogenetic ah oo lagu saleeyay 34 hiddo-side BjGRF ah oo la aqoonsaday (Jaantuska 1). Saddexda qoys ee hoose waxay ka kooban yihiin tirooyin kala duwan oo xubno ah; 116 GRF TFs waxaa loo qaybiyaa saddex qoys oo kala duwan (kooxo A~C), oo ka kooban 59 (50.86%), 34 (29.31%) iyo 23 (19.83)% GRFs, siday u kala horreeyaan. Kuwaas, 34 xubnood oo qoyska BjGRF ah ayaa ku kala firirsan 3 qoys oo hoose: 13 xubnood oo kooxda A ah (38.24%), 12 xubnood oo kooxda B ah (35.29%) iyo 9 xubnood oo kooxda C ah (26.47%). Inta lagu jiro habka polyploidization-ka mustard-ka, tirada hiddo-sidayaasha BjGRF ee qoysaska hoose way kala duwan yihiin, waxaana dhici karta in hidde-sidayaasha iyo khasaaraha ay dhaceen. Waxaa xusid mudan in aysan jirin qaybinta bariiska iyo millet-ka GRF ee kooxda C, halka ay jiraan 2 bariis GRF iyo 1 millet-GRF oo kooxda B ah, inta badan bariiska iyo millet-ka GRF-yada waxaa lagu kala saaraa hal laan, taasoo muujinaysa in BjGRF-yadu ay si dhow ula xiriiraan dicots. Kuwaas waxaa ka mid ah, daraasadaha ugu qoto dheer ee ku saabsan shaqada GRF ee Arabidopsis thaliana waxay saldhig u yihiin daraasadaha shaqada ee BjGRF-yada.
Geedka phylogenetic-ga ee khardal oo ay ku jiraan Brassica napus, Brassica napus, bariis, masago iyo xubno ka tirsan qoyska Arabidopsis thaliana GRF.
Falanqaynta hiddo-sidayaasha soo noqnoqda ee qoyska mustard GRF. Khadka cawlan ee asalka ah wuxuu matalaa baloog isku-dhafan oo ku jira hiddo-sidayaasha mustard, khadka cas wuxuu matalaa laba jeer oo ku-celcelin ah oo hidde-sidayaasha BjGRF ah;
Muujinta hidda-wadaha BjGRF ee cadaadiska abaarta marxaladda caleen afraad. Xogta qRT-PCR waxaa lagu muujiyay Shaxda Dheeraadka ah S5. Kala duwanaansho muhiim ah oo ku saabsan xogta waxaa lagu muujiyay xarfo yaryar.
Iyadoo cimilada adduunku ay sii socoto inay isbeddesho, barashada sida dalagyada ula qabsadaan walbahaarka abaarta iyo hagaajinta hababka dulqaadka ayaa noqotay mowduuc cilmi baaris oo kulul18. Ka dib abaarta, qaab-dhismeedka qaab-dhismeedka, muujinta hidda-wadaha iyo hababka dheef-shiid kiimikaadka ee dhirtu way isbeddeli doonaan, taas oo horseedi karta joojinta sawir-qaadista iyo khalkhalka dheef-shiid kiimikaadka, taasoo saameynaysa wax-soo-saarka iyo tayada dalagyada19,20,21. Marka dhirtu dareento calaamadaha abaarta, waxay soo saaraan farriin labaad sida Ca2+ iyo phosphatidylinositol, waxay kordhiyaan fiirsashada calcium ion-ka gudaha unugyada waxayna dhaqaajiyaan shabakadda sharciyeynta ee marin-haweedka fosfoorasaydhka borotiinka22,23. Borotiinka ugu dambeeya ee bartilmaameedka ah wuxuu si toos ah ugu lug leeyahay difaaca unugyada ama wuxuu nidaamiyaa muujinta hidda-wadaha walbahaarka ee la xiriira iyada oo loo marayo TFs, taasoo kor u qaadaysa dulqaadka dhirta ee walbahaarka24,25. Sidaa darteed, TFs waxay door muhiim ah ka ciyaaraan ka jawaabista walbahaarka abaarta. Sida laga soo xigtay sifooyinka isku xigxiga iyo isku xidhka DNA-da ee TF-yada ka jawaaba walbahaarka abaarta, TFs waxaa loo qaybin karaa qoysas kala duwan, sida GRF, ERF, MYB, WRKY iyo qoysas kale26.
Qoyska hidda-wadaha GRF waa nooc ka mid ah TF-ga gaarka u ah dhirta kaas oo door muhiim ah ka ciyaara dhinacyo kala duwan sida koritaanka, horumarka, wareejinta calaamadaha iyo jawaabaha difaaca dhirta27. Tan iyo markii hidda-wadaha GRF ee ugu horreeyay lagu aqoonsaday O. sativa28, hidda-wadaha GRF oo aad u badan ayaa lagu aqoonsaday noocyo badan waxaana la muujiyay inay saameeyaan koritaanka dhirta, horumarka iyo jawaabta walbahaarka8, 29, 30, 31, 32. Markii la daabacay taxanaha hidda-wadaha Brassica juncea, aqoonsiga qoyska hidda-wadaha BjGRF ayaa suurtogal noqotay33. Daraasaddan, 34 hiddo-wade BjGRF ayaa lagu aqoonsaday hidda-wadaha mustard-ka oo dhan waxaana loogu magac daray BjGRF01–BjGRF34 iyadoo lagu saleynayo booska koromosoomkooda. Dhammaantood waxay ka kooban yihiin domains QLQ iyo WRC oo aad loo ilaaliyo. Falanqaynta sifooyinka fiisikoolojiga ayaa muujisay in kala duwanaanshaha tirooyinka amino acid iyo miisaanka molecular-ka ee borotiinada BjGRF (marka laga reebo BjGRF28) aysan ahayn kuwo muhiim ah, taasoo muujinaysa in xubnaha qoyska BjGRF ay yeelan karaan shaqooyin isku mid ah. Falanqaynta qaab-dhismeedka hidda-wadaha ayaa muujisay in 64.7% hidda-wadaha BjGRF ay ka kooban yihiin 4 exons, taasoo muujinaysa in qaab-dhismeedka hidda-wadaha BjGRF uu si xad dhaaf ah u ilaaliyo horumarka, laakiin tirada exons-ka ee hidda-wadaha BjGRF10, BjGRF16, BjGRP28 iyo BjGRF29 ay ka weyn tahay. Daraasaduhu waxay muujiyeen in ku darista ama tirtiridda exons ama introns ay horseedi karto kala duwanaansho qaab-dhismeedka hidda-wadaha iyo shaqada, taasoo abuuraysa hiddo-wadeyaal cusub34,35,36. Sidaa darteed, waxaan qiyaaseynaa in intron-ka BjGRF uu lumay intii lagu jiray horumarka, taasoo sababi karta isbeddello ku yimaada shaqada hidda-wadaha. Iyadoo la raacayo daraasadaha jira, waxaan sidoo kale ogaanay in tirada introns-ka ay la xiriirtay muujinta hidda-wadaha. Marka tirada introns-ka ee hidda-wadaha ay weyn tahay, hidda-wadaha si dhakhso ah ayuu uga jawaabi karaa arrimo kala duwan oo aan wanaagsanayn.
Ku-darka hidda-wadaha waa arrin muhiim ah oo ku saabsan horumarka hidda-wadaha iyo hidde-sidaha37. Daraasado la xiriira ayaa muujiyay in ku-darka hidda-wadaha uusan kaliya kordhin tirada hidda-wadaha GRF, laakiin sidoo kale uu u adeego sidii hab lagu soo saaro hiddo-wadeyaal cusub si looga caawiyo dhirta inay la qabsato xaaladaha deegaanka ee kala duwan38. Wadarta 48 lammaane hidda-wade oo isku-dhafan ayaa laga helay daraasaddan, dhammaantoodna waxay ahaayeen ku-darka qaybo, taasoo muujinaysa in ku-darka qaybo ay yihiin habka ugu weyn ee lagu kordhinayo tirada hidda-wadaha ee qoyskan. Waxaa lagu soo warramey suugaanta in ku-darka qaybo ay si wax ku ool ah u horumarin karto kordhinta xubnaha qoyska hidda-wadaha GRF ee Arabidopsis iyo strawberry, mana jirin ku-darka tandem ee qoyskan hidde-sidaha oo laga helay mid ka mid ah noocyada27,39. Natiijooyinka daraasaddan waxay la jaan qaadayaan daraasadaha jira ee ku saabsan qoysaska Arabidopsis thaliana iyo strawberry, taasoo soo jeedinaysa in qoyska GRF ay kordhin karaan tirada hidda-wadaha oo ay abuuri karaan hiddo-wadeyaal cusub iyada oo loo marayo ku-darka qaybo ee dhirta kala duwan.
Daraasaddan, wadarta 34 hiddo-side BjGRF ayaa lagu aqoonsaday mustard, kuwaas oo loo qaybiyay 3 qoys oo hoose. Hiddo-sideyaashani waxay muujiyeen qaabab la mid ah oo la ilaaliyay iyo qaab-dhismeedka hiddo-sideyaasha. Falanqaynta Collinearity waxay muujisay 48 lammaane oo isku-darka qaybaha ah ee mustard. Gobolka dhiirrigeliyaha BjGRF wuxuu ka kooban yahay walxo cis-dhaqdhaqaaqa oo la xiriira jawaab-celinta iftiinka, jawaabta hoormoonka, jawaabta walbahaarka deegaanka, iyo koritaanka iyo horumarka. Muujinta 34 hiddo-side BjGRF ayaa lagu ogaaday marxaladda abuurka mustard (xididdada, jirridaha, caleemaha), iyo qaabka muujinta 10 hiddo-side BjGRF xaaladaha abaarta. Waxaa la ogaaday in qaababka muujinta hiddo-sideyaasha BjGRF ee hoos yimaada cadaadiska abaarta ay isku mid ahaayeen oo ay isku mid noqon karaan. ku lug lahaanshaha xakamaynta qasabka abaarta. Hiddo-sideyaasha BjGRF03 iyo BjGRF32 waxay ka ciyaari karaan doorar nidaamin oo wanaagsan walaaca abaarta, halka hiddo-sideyaasha BjGRF06 iyo BjGRF23 ay door ka ciyaaraan walaaca abaarta iyagoo ah hiddo-sideyaasha bartilmaameedka miR396. Guud ahaan, daraasaddeennu waxay bixisaa saldhig bayooloji ah oo loogu talagalay helitaanka mustaqbalka ee shaqada hiddo-sideyaasha BjGRF ee dhirta Brassicaceae.
Iniinta iniinyaha khardal ee loo isticmaalay tijaabadan waxaa bixiyay Machadka Cilmi-baarista Iniinta Saliidda Guizhou, Akadeemiyada Cilmiga Beeraha ee Guizhou. Xullo iniinyaha oo dhan oo ku beer ciidda (substrate: carro = 3:1), oo ururi xididada, jirridaha iyo caleemaha ka dib marxaladda afar-caleen. Dhirta waxaa lagu daaweeyay 20% PEG 6000 si loogu daydo abaarta, caleentana waxaa la ururiyay 0, 3, 6, 12 iyo 24 saacadood ka dib. Dhammaan muunadaha dhirta waxaa isla markiiba lagu qaboojiyay nitrogen dareere ah ka dibna waxaa lagu kaydiyay qaboojiyaha -80°C si loogu sameeyo tijaabada xigta.
Dhammaan xogta la helay ama la falanqeeyay inta lagu guda jiray daraasaddan waxaa lagu daray maqaalka la daabacay iyo faylasha macluumaadka dheeraadka ah.


Waqtiga boostada: Jan-22-2025